- Российский алгоритм MAHDS для сопоставления последовательностей аминокислот превосходит зарубежные аналоги.
- Решение позволяет изучать эволюционные изменения в структуре белков сотни миллионов лет назад.
- Математическая модель MAHDS находит общие признаки в последовательностях аминокислот различных белков.
- Сравнение разных белков позволяет определить родство организмов, которым они принадлежат.
- Российские ученые сравнили эффективность нескольких математических моделей, включая AlphaFold, T-Coffee, MUSCLE и другие.
- Метод MAHDS показал статистически значимые результаты, в то время как другие алгоритмы выдали случайные совпадения фрагментов.
- Новый математический метод уже работает и доступен для любого пользователя.
- Результаты исследования опубликованы в журнале Symmetry.
«Мы показали, что метод MAHDS позволяет получить статистически значимые результаты там, где остальные методы выдают совершенно случайный вариант множественного выравнивания последовательностей. Наш новый математический метод уже работает, и мы создали доступный для любого пользователя сервер», - уточнил соавтор публикации Дмитрий Костенко, младший научный сотрудник группы математического анализа последовательностей ДНК и белков ФИЦ Биотехнологии РАН