Фолдинг белка на ноутбуке. De novo дизайн KRAS G12D (Switch II) ингибитора. Докинг, валидация в AlfaFold Server и PyMOL

Разработка ингибиторов мутантного онкобелка KRAS G12D - важная задача онкофармакологии.
Проприетарный метод использован для расчета нескольких секвенсов под целевой карман мишени.
Результаты докинга в AlfaFold Server: ipTM от 0.58 до 0.92.
Разработан авторский 14-мерный пептид для кармана Switch II KRAS G12D.
BLASTp подтвердил уникальность структуры пептида.
Пептид является полностью авторским и получен методом de novo.
Валидация в AlfaFold Server и визуализация в PyMOL: высокая уверенность в стабильности комплекса.
Геометрия связей и расстояния между ключевыми атомами подтверждают формирование водородных связей и электростатических контактов.
Работа выполнена полностью методами in silico, требуется физическое подтверждение константы связывания.