• Ученые ИТМО разработали алгоритм Strainy для быстрого анализа ДНК бактерий.
• Алгоритм позволяет выделить вариации ДНК бактерий и разделить близкородственные штаммы.
• Разработка помогает определить уровень патогенности и устойчивости к антибиотикам бактерий.
• Микробиом - скопление сотен микроорганизмов, каждый из которых по-разному воздействует на человека и окружающую среду.
• Современные алгоритмы не могут выделить конкретные штаммы внутри сообществ и определить их уникальные свойства.
• Алгоритм ИТМО работает с данными метагенома в два этапа: кластеризация и перестройка метагенома.
• Полученные данные могут использоваться для определения свойств бактерий, включая патогенность и устойчивость к антибиотикам.
• Информация также помогает изучить эволюцию и мутацию бактерий, а также прогнозировать изменения в геноме.