• МГУ предложил подход для вычислительного проектирования белков, взаимодействующих с ДНК и РНК.
• Авторы использовали дополнительные механизмы управления построением белковой структуры.
• Лучший результат дало сочетание двух механизмов, учитывающих качество связывания и устойчивость белка.
• Работа опубликована в Journal of Chemical Information and Modeling.
• Методы искусственного интеллекта используются для проектирования белков с заданными свойствами, но создание белков, связывающихся с нуклеиновыми кислотами, остается сложной задачей.
• Предложенный подход помогает сбалансировать качество взаимодействия белка с нуклеиновой кислотой и устойчивость структуры.
• Единые подходы не всегда одинаково хорошо работают для разных типов молекулярных объектов, поэтому требуется гибкая настройка под конкретные задачи проектирования.
• Полученные результаты могут использоваться при дальнейшем развитии методов проектирования белков, взаимодействующих с нуклеиновыми кислотами и в молекулярной биологии и генной терапии.

«При вычислительном проектировании белков важно учитывать не только качество их взаимодействия с ДНК или РНК, но и способность самой белковой структуры оставаться устойчивой. В нашей работе мы показали, что сочетание нескольких механизмов управления процессом проектирования позволяет лучше сбалансировать эти требования и получить более качественные результаты вычислительного моделирования», — отметил профессор факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ, старший научный сотрудник Исследовательского центра в сфере искусственного интеллекта МГУ Андрей Головин.